L’any 2005 es va dur a terme un estudi amb l’objectiu d’inventariar tots els espais naturals inclosos a la Xarxa Natura 2000 on es localitza algun tram d’autopista gestionada per les empreses d’abertis a Espanya: acesa, aucat, Aulesa, aumar, iberpistas i castellana.

La Xarxa Natura 2000 actualment s’estableix com la base principal per a la representació d’espais naturals protegits, ja que, malgrat no estar definitivament aprovada per la Unió Europea, es tracta d’una xarxa d’espais naturals que engloba i amplia bona part dels que es troben protegits, ja sigui dins l’àmbit nacional o bé dins del de les comunitats autònomes.